A l'origine, la malachite était utilisée en amulette contre les enchantements et le mauvais oeil. Les Anciens gravaient le soleil sur la pierre parce qu'ils croyaient que la lumière était l'antithèse de la magie noire, des nécromanciens et des démons.
Pline dit que la malachite, un prophylactique naturel contre le danger, favorisait les mères qui allaitaient et protégeaient les enfants.
Durant l'Antiquité et le Moyen Âge, la pierre a été utilisée pour soigner les yeux. Selon une ancienne comptine : "De teinte opaque, vert vif comme l'émeraude, [la malachite] charme la vision."